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有價證券上市公司違反本辦法或於申報期限截止後自行發現申報之資訊有錯誤申請更正者，本公司得課新台幣一萬元之違約金，但其錯漏如係由主管機關、本公司或投資人發現經查屬實者，得依個案處以新台幣參萬元之違約金，但其於最近一年內累計課處次數達二次以上(含本次)、個案情節出於故意或重大缺失、或對股東權益或證券價格具重大影響者，本公司得處以伍萬元至壹佰萬元之違約金。須補正或更正者，並函知上開公司於文到後二營業日內辦理，如再未依限辦理者，每逾一營業日課新台幣一萬元之違約金，至辦理日為止，並得經由本公司資訊傳輸系統揭示週知。
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經本公司按日處以違約金，仍未依限辦理且個案情節重大者，本公司得依營業細則第四十九條或第五十條規定，對其上市有價證券變更原有交易方法或停止其買賣。
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以封閉式基金或指數股票型基金之受益憑證、基金股份或投資單位上市之證券投資信託事業或境外基金機構之總代理人違反本辦法或於申報期限截止後自行發現申報之資訊有錯誤申請更正者，本公司得處證券投資信託事業或境外基金機構新台幣一萬元之違約金，但其錯漏如係由主管機關、本公司或投資人發現經查屬實者，處以伍萬元之違約金，並均函知其應於文到後二營業日內補正或更正；未按期限補正者，每逾一營業日處新台幣一萬元之違約金，至補正日為止。
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上市公司、第一上市及第二上市公司重大訊息輸入之違約處理，另依本公司「對有價證券上市公司重大訊息之查證暨公開處理程序」第九條規定辦理；以封閉式基金或指數股票型基金之受益憑證上市之證券投資信託事業重大訊息輸入之違約處理，另依本公司「對上市證券投資信託基金之證券投資信託公司重大訊息之查證暨公開處理程序」第七條規定辦理。
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上市公司、第一上市及第二上市公司違反本資訊申報作業辦法，被處以違約金之情形，於公開資訊觀測站之「上市公司違反資訊申報、重大訊息及說明記者會規定專區」揭示。